佛山都市妇产医院妇科指出，导致巧克力囊肿的原因有：

　　原因一：压力过大——这是造成卵巢巧克力囊肿的主要原因，长期的精神压力过大会引起植物神经功能紊乱，影响人体内分泌的平衡也是发病诱因。

　　原因二：内分泌因素——卵巢虽然小，但却是生成卵子并排卵、分泌激素的重要器官之一，多出现在内分泌旺盛的生育年龄。因此认为和内分泌失调有关。

　　原因三：分娩、多次流产等——巧克力囊肿主要是由于月经期子宫壁脱落的子宫内膜碎片因引流不畅，不能全部从阴道排出，有少量经输卵管向盆腔倒流。

　　原因四：性生活频繁——性生活频繁也是导致卵巢巧克力囊肿的重要原因，一般发病多在青春期少女或更期妇女，这与她们频繁性生活有很大关系。