佛山都市妇产医院妇科指出，巧克力囊肿的症状有：

　　症状一：不孕_不明原因不孕患者中，约30-40%患内异症。内异症患有不孕，常因病变造成盆腔肿块、输卵管堵塞卵泡发育不好或排卵障碍等因素引起。

　　症状二：痛经​——自发生内膜异位开始，以往月经来潮时并无疼痛，从某一个时期开始出现痛经。有的痛经较重难忍，需要卧床休息或用药止痛。

　　症状三：月经不调——卵巢巧克力囊肿的症状常有月经周期缩短或经期延长等现象，说明患者有卵巢功能障碍表现。月经不调可作诊断参考，但在鉴别诊断中并无价值。

　　症状四：性交痛——巢粘连在盆底时，均可产生性交痛。外源性压迫输尿管，使其狭窄阻塞，出现泌尿系统卵巢巧克力囊肿症状。

　　症状五：周期性膀胱刺激症状——内异症病变累及膀胱腹膜反褶时，出现经期尿急、尿频等症状。

　　症状六：周期性下腹不适——出现于轻症患者，由于痛阈的个性差异或其他原因，不产生痛经症状而仅有经期腰酸、下腹坠胀不适感。